95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5224 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  97.3 
 
 		 74 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  94.2 
 
 		 70 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  72.22 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  71.83 
 
 		 74 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  80 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  50.94 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  50.91 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  48.84 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  51.16 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  51.22 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  48.84 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  58.97 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  58.97 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  48.72 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  44.07 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  55.81 
 
 		 202 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  43.48 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  58.97 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  50 
 
 		 248 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  52.38 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  52.38 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  44.68 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  40.98 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  45.24 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  35.19 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  46.34 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  34.09 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  45 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  40.91 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  45.24 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  41.46 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  41.3 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  38.3 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  38.98 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  43.9 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  46.51 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  52.38 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.19 
 
 		 221 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  43.75 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  34.78 
 
 		 303 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  34.09 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  34.09 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  51.22 
 
 		 66 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.92 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  34.09 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  34.09 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  51.43 
 
 		 285 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  46.67 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  46.67 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  46.67 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  36.92 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  35.71 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  44.19 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  42.22 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  39.02 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  29.55 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  44.19 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  31.91 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  48.48 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  43.48 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  43.48 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  34.04 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  32.61 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  41.03 
 
 		 74 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  45.45 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  42.55 
 
 		 70 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  41.82 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  45.24 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  32.56 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  47.62 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  34.09 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  35.42 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  38.64 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  36.07 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  37.04 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  47.5 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  36.96 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  42.42 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  42.42 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  36.96 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  38.64 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  38.46 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  42.86 
 
 		 52 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  40.43 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  34.88 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0775  hypothetical protein  39.02 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.385738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  42.55 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  34.88 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>