111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5495 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  75 
 
 		 78 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  71.83 
 
 		 74 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  71.83 
 
 		 74 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  72.22 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  71.83 
 
 		 74 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  75.81 
 
 		 70 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  50.94 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  51.92 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  38.6 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  41.67 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  35.62 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  44.68 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  46.15 
 
 		 267 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  44.68 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  44.68 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  45.61 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  44.64 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  46.3 
 
 		 94 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  38.78 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  47.17 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  47.17 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  42 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  38.78 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  38.78 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  44.64 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  47.62 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  41.51 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  48.72 
 
 		 285 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  48.15 
 
 		 202 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  40.82 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  45.28 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  42.55 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  41.51 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  38.6 
 
 		 72 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  46.67 
 
 		 248 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  44.44 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  46.43 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  46.43 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  46.43 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  43.4 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  42.55 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  46 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  38 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  43.4 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  39.34 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  40.43 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  40.43 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  40.43 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  38 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  41.82 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  41.38 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  41.82 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  37.5 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  45.24 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  43.14 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  36.84 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  42.59 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  52.38 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  46 
 
 		 52 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  39.29 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  40 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  43.86 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  40.48 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  35.48 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  41.3 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  38.78 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  33.93 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  36.73 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  36.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  32.26 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  38.6 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  44.9 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  38.18 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  39.62 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  44.44 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  40.38 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  47.73 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  42.11 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  38.18 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  33.96 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  32.73 
 
 		 303 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  42.22 
 
 		 65 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  40.74 
 
 		 88 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  32 
 
 		 64 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  35.42 
 
 		 121 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  35.42 
 
 		 121 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  41.67 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  37.1 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>