71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1363 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  158  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  66.67 
 
 		 74 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  67.12 
 
 		 77 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  65.33 
 
 		 77 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  68.49 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  64 
 
 		 77 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  64 
 
 		 77 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  64.38 
 
 		 76 aa  100  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  61.64 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  61.64 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  61.64 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  61.64 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  60 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  60.27 
 
 		 81 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  48.65 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  47.3 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  42.37 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  58.97 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  44.23 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  36.51 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  41.67 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  41.67 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  35.85 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  39.34 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  38.46 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  39.34 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  38.98 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  43.9 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  42.55 
 
 		 285 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  43.59 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  38 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  45 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  45 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  38.46 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  45 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  35.19 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  41.3 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  37.74 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  37.25 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  35.29 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  37.04 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  37.93 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  32.73 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  42.55 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  37.74 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  39.02 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.68 
 
 		 250 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  31.37 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0775  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.385738  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  34.69 
 
 		 64 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  38.78 
 
 		 202 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  45 
 
 		 248 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  39.58 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  43.9 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  39.22 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  41.18 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.67 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  32.76 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  36.73 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  36 
 
 		 88 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  34.62 
 
 		 76 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  31.37 
 
 		 85 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>