65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1710 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  62.82 
 
 		 83 aa  110  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  63.51 
 
 		 77 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  61.04 
 
 		 77 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  62.16 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  61.04 
 
 		 77 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  61.04 
 
 		 77 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  61.04 
 
 		 77 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  62.16 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  62.16 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  56.96 
 
 		 81 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  62.16 
 
 		 77 aa  97.8  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  60.81 
 
 		 76 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  61.11 
 
 		 74 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  60.27 
 
 		 75 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  53.42 
 
 		 82 aa  91.3  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  39.29 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  40.82 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  41.27 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  41.27 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  41.82 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  36.54 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  36.51 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  41.27 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  39.22 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  54.05 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  43.75 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  39.13 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  42 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  42.31 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  45.1 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  39.22 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  35.19 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  35.19 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  35.19 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  55.56 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  46.94 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  45.28 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  36.73 
 
 		 248 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  36.36 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  31.48 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  41.46 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  40.38 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  34.69 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  44.9 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  32.65 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  52.94 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  38.3 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  52.94 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  30.91 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  27.78 
 
 		 267 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  56.25 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  36 
 
 		 55 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  47.06 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  41.51 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  34.55 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>