54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0270 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  130  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  60.42 
 
 		 56 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  54 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  50.98 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  42.62 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  45 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  46.3 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  45.28 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  42.59 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  48.98 
 
 		 76 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  47.73 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  48.98 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  48.98 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  45.45 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  55.26 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  64.52 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  55.26 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  55.26 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  41.46 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  46.94 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  39.62 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  41.46 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  44.64 
 
 		 60 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 74 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  39.34 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  48.78 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  48.78 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  48.78 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  40.98 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  48.78 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  53.06 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  51.02 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  38.6 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  42 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  44.64 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  37.7 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  38 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  43.14 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  38.46 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  42.31 
 
 		 59 aa  40  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  39.02 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>