104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2867 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  133  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  43.64 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  40 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  41.82 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  41.82 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  38.71 
 
 
71 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  40.35 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  46.15 
 
 
60 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  36.84 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  41.51 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  45.83 
 
 
74 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  41.51 
 
 
72 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  46.94 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  39.62 
 
 
85 aa  50.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  43.75 
 
 
81 aa  50.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  43.4 
 
 
70 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  37.93 
 
 
72 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  36.73 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  40 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  46.81 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  45.83 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  45.83 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  45.83 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  45.83 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  35.71 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  44.68 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  39.22 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  36 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  41.18 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  36 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  41.07 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  33.96 
 
 
303 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  43.48 
 
 
285 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 
88 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  37.25 
 
 
68 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  40 
 
 
81 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  36.73 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  34.69 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  34.55 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  36 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  39.29 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  29.09 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  34.55 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  38.78 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  35.19 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  34.55 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  44.68 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  41.67 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  42 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  39.22 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  41.51 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  39.29 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  39.22 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  34.55 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  36 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  36.73 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  31.48 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  38.46 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  32.73 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.29 
 
 
250 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  35.85 
 
 
58 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  31.91 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  36.17 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  39.02 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  32.08 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  37.5 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  41.18 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  31.91 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  31.91 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  31.91 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  36.54 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  36.54 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  32 
 
 
74 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  34.69 
 
 
75 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  36.54 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  36.54 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  36.54 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  36.54 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  36.54 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  34.69 
 
 
248 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  38 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  34.78 
 
 
267 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  37.25 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  34.04 
 
 
55 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  41.3 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  37.78 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36 
 
 
221 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  37.25 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>