84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2617 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  159  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  159  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  98.7 
 
 		 77 aa  158  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  87.01 
 
 		 77 aa  143  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  80.26 
 
 		 77 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  80.26 
 
 		 77 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  80.26 
 
 		 77 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  77.92 
 
 		 77 aa  130  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  80.26 
 
 		 77 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  69.44 
 
 		 76 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  62.5 
 
 		 74 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  67.61 
 
 		 83 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  64 
 
 		 75 aa  103  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  62.16 
 
 		 81 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  53.42 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  46.67 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  48.08 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  48.08 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  48.08 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  48.08 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  46.94 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  45.83 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  41.67 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  48.94 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  42 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  46.81 
 
 		 285 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  44 
 
 		 58 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  41.67 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  42.31 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  37.04 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  46.3 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  46.94 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  43.75 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  41.3 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  39.22 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05426  hypothetical protein  51.11 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  40.43 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  41.67 
 
 		 267 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  40.43 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  37.68 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  37.04 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  40.43 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  35.71 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  37.04 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  39.29 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  39.29 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  39.29 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  41.18 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  47.62 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.86 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  38.3 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  39.58 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  40.38 
 
 		 248 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  44.68 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  43.75 
 
 		 68 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  43.75 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  45 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  43.75 
 
 		 68 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  41.67 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  39.13 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  39.02 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0775  hypothetical protein  32.2 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.385738  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  42.42 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  36.59 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  36.17 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  32.86 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  41.3 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  42.42 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  37.25 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  39.22 
 
 		 56 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  40.82 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  42.42 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  35.59 
 
 		 69 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  36.59 
 
 		 72 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>