60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2482 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  95.59 
 
 		 68 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  88.06 
 
 		 71 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  78.12 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  62.12 
 
 		 76 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  62.12 
 
 		 76 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  62.12 
 
 		 76 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  61.9 
 
 		 70 aa  94  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  60.61 
 
 		 76 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  53.03 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  50.98 
 
 		 77 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  50.98 
 
 		 77 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  50.98 
 
 		 77 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  50.98 
 
 		 77 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  41.82 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  48 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  54.05 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  45.28 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  37.74 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  47.83 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  36.54 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  38.98 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  32.73 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  39.22 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  62.5 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  35.59 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  44.19 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  41.86 
 
 		 285 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  32.26 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  41.3 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  63.33 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  47.73 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  33.93 
 
 		 267 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  47.37 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  41.67 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  31.58 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  30.65 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  32.69 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 78 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  47.37 
 
 		 64 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  47.37 
 
 		 71 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  31.58 
 
 		 88 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  38 
 
 		 56 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  47.37 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  28.57 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  36.96 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  36.96 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  36.96 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  36.96 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  41.18 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  43.14 
 
 		 65 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>