85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1678 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  157  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  97.37 
 
 		 76 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  97.37 
 
 		 76 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  96.05 
 
 		 76 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  67.69 
 
 		 70 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  61.76 
 
 		 71 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  65.15 
 
 		 68 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  62.12 
 
 		 68 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  62.12 
 
 		 71 aa  94.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  58.62 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  53.85 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  48.08 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  48.08 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  49.02 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  40.38 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  38.3 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  43.75 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  43.75 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  43.75 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  43.75 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  47.46 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  40.35 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  43.86 
 
 		 267 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  45.76 
 
 		 64 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  41.27 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  42.31 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  45.61 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  56.76 
 
 		 285 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  44.68 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  46.15 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  33.96 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  46.15 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  39.58 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  47.83 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  40.35 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  42 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  34.69 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  45.45 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  46.51 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  45.45 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  42 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  42 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  43.14 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  40.38 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  37.7 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  42.31 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  60.61 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  38.6 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  37.74 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  38.98 
 
 		 248 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  46.67 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  46.67 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  46.67 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  45.95 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  35 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  32.2 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  40.38 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  44.9 
 
 		 68 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  44.9 
 
 		 68 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  38.89 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  38.78 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  36.36 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  44.9 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  46.94 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  34 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.86 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  40.35 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2468  hypothetical protein  42.86 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.835928  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  39.58 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  34.69 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  35.09 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  39.58 
 
 		 70 aa  40  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3773  protein of unknown function DUF1289  48.72 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  35.48 
 
 		 87 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>