136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3352 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  150  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  52.17 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  52.24 
 
 
79 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  50.75 
 
 
82 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  60.71 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.26 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  53.12 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  53.12 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  59.26 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  55.1 
 
 
248 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  57.69 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.67 
 
 
251 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  56.14 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  58 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  62.5 
 
 
52 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  60 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  60 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  51.79 
 
 
58 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  49.09 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  59.09 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  59.09 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  55.1 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  51.85 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  51.85 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  51.85 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  47.27 
 
 
64 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  53.06 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  49.02 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.17 
 
 
221 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  52 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  52.17 
 
 
202 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  45.45 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  52 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  47.27 
 
 
64 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  52 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  41.07 
 
 
76 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  47.62 
 
 
61 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  47.62 
 
 
57 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  43.1 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  52.38 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  40.74 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  38.46 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  40.82 
 
 
57 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  48 
 
 
78 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  45.83 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  48 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  39.73 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  42 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  46 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  46 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  46.94 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  40 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  44 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  46.94 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  43.48 
 
 
72 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  47.62 
 
 
76 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  47.62 
 
 
76 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  49.02 
 
 
66 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 
72 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  43.14 
 
 
70 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  43.18 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  34.69 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  42.11 
 
 
73 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  44 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  51.16 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  41.82 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  48.84 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  46.94 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3773  protein of unknown function DUF1289  46.34 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  41.3 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  41.3 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  41.3 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  41.3 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  40.74 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  43.64 
 
 
303 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  42.86 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  42.86 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  43.14 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  44.44 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  38.78 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  44 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  38.3 
 
 
155 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  38.3 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  35.71 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  42.31 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  38.78 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  35.71 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  38.3 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  41.3 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  42.22 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  41.3 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>