101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0179 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  157  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  91.03 
 
 		 78 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  75 
 
 		 74 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  72.22 
 
 		 74 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  72.22 
 
 		 74 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  72.22 
 
 		 74 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  78.46 
 
 		 70 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  57.69 
 
 		 56 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  39.29 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  41.67 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  51.16 
 
 		 267 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  40.35 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  40.35 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  36.54 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  46.15 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  40.35 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  46.15 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  48.08 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  48.08 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  37.93 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  38.6 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  38.18 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  45.83 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  46.15 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  48.78 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  36.23 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  37.04 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  37.04 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  35.85 
 
 		 76 aa  48.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  53.49 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  35.71 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  44.44 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  45.65 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  34 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  44.44 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  40 
 
 		 248 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  46.34 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.92 
 
 		 250 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  33.93 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  44.64 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  35.85 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  35.59 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  38.98 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  37.29 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  43.59 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  32.31 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  33.96 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  41.67 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  33.96 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  33.96 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  33.96 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  35.29 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  45.1 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  35.59 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  45.1 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  40.74 
 
 		 59 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  45.28 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  41.82 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  29.09 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  30 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  45.1 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  40.38 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  39.58 
 
 		 285 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  44.9 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  44.9 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  43.4 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  34.43 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  35.59 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  32.14 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  34.69 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  39.62 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  40.38 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  37.29 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  40.74 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  40.74 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  40.82 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  38.98 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  36.59 
 
 		 106 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  42.22 
 
 		 63 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  45.83 
 
 		 70 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  37.74 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  37.21 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  40.43 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  42.11 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.73 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  36.54 
 
 		 57 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  37.21 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  45.83 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  34.62 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  43.48 
 
 		 84 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>