101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3754 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  190  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  97.87 
 
 		 94 aa  187  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  57.32 
 
 		 202 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  74.55 
 
 		 81 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  55.56 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  55.07 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48 
 
 		 251 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  53.45 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  55.36 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  53.33 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  58.33 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  53.7 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  59.09 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.1 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  46.15 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  53.85 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  53.85 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  44.44 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  56.86 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  53.06 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  48.98 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  38.78 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  44.16 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  44.16 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  47.92 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  52.38 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  50.98 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  42.86 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  52.38 
 
 		 52 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  52.38 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  46.3 
 
 		 74 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  52.38 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  52.38 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  48.94 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  46.43 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  44.64 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  45.45 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  38.98 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  45.24 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  47.92 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  34.18 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  45.45 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  34.18 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  40.74 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  43.4 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  38.46 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  43.1 
 
 		 285 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  47.62 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  47.62 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  47.62 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.35 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  40.48 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  40.74 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  40.91 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  41.51 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  45.24 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  44.9 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  41.51 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  43.75 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  41.51 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  40.82 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  36.59 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  39.58 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  36 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  39.62 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  38.6 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  35.29 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  38 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  32.65 
 
 		 172 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  39.62 
 
 		 72 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  52.5 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  32.65 
 
 		 171 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  42.55 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  36.54 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  31.71 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  34.15 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  35.71 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  37.1 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  35.71 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  34.15 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  41.03 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  38.1 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  34.04 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  32.61 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  47.62 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  48.28 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  29.58 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  38.89 
 
 		 70 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  36.73 
 
 		 64 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>