69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3430 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  321  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  93.51 
 
 		 171 aa  303  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  94.7 
 
 		 172 aa  303  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  93.55 
 
 		 155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  82.47 
 
 		 169 aa  271  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  82.12 
 
 		 156 aa  263  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  80.52 
 
 		 158 aa  262  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  82.78 
 
 		 156 aa  261  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  78.71 
 
 		 155 aa  258  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  79.61 
 
 		 155 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  76.62 
 
 		 158 aa  247  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  49.64 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  39.81 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  45.1 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  40.38 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  45.83 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  47.83 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  48.94 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  41.18 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  40.82 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  44.9 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  37.04 
 
 		 248 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  46.81 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  46.81 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  46.67 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  43.48 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  45.65 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  47.73 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  40.91 
 
 		 83 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  40.91 
 
 		 89 aa  48.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  42.22 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  42.22 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  33.96 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  42.22 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.29 
 
 		 250 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  44.68 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  43.18 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  40.91 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  33.33 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  34.62 
 
 		 85 aa  44.3  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  33.33 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  38.3 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  34.48 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  33.9 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  30.16 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  33.93 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  32.69 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  34.48 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  32.69 
 
 		 94 aa  41.2  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  35.71 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  34.04 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  39.13 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  31.37 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  39.02 
 
 		 59 aa  40.4  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>