64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1894 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  330  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  50.35 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  49.64 
 
 		 155 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  52.52 
 
 		 169 aa  154  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  48.92 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  47.52 
 
 		 171 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  47.52 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  47.52 
 
 		 172 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  46.81 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  48.92 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  48.92 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  46.81 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  33.63 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  37.14 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  42.11 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  43.86 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  55.56 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  42.11 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  38.98 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  29.33 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  36.84 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  38.6 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  37.14 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  46.81 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  37.14 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  35 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  40.38 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 267 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  51.11 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  40.38 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  37.78 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  35.09 
 
 		 143 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  47.73 
 
 		 67 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  45.45 
 
 		 80 aa  43.9  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  44.44 
 
 		 67 aa  43.9  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  47.73 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  39.13 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  37.25 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  46.67 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  32.81 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  32.81 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  32.81 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  32.81 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0775  hypothetical protein  41.3 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.385738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  32 
 
 		 303 aa  41.2  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  31.37 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.46 
 
 		 250 aa  40.8  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  32.08 
 
 		 248 aa  40.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  33.87 
 
 		 72 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>