73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1404 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  100 
 
 		 86 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  98.84 
 
 		 86 aa  177  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  71.43 
 
 		 91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  71.43 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  69.84 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  69.84 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  69.84 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  69.84 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  69.84 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  69.84 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  69.84 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  66.67 
 
 		 83 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  68.25 
 
 		 67 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  59.21 
 
 		 80 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  66.67 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  66.67 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  65.08 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  57.14 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  66.04 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  44.3 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  42.35 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  42.35 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  47.54 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  40.26 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  42.11 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  53.19 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  40.26 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  48.94 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  46.67 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  48.94 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  38.96 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  46.67 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  48.98 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  53.57 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  47.73 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  47.73 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  40.38 
 
 		 64 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  44.44 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  45.45 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  42.22 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  44.19 
 
 		 267 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  36.54 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  40.38 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  43.18 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  37.88 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  45.24 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  46.15 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  38.6 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  36.54 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  43.59 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  36.51 
 
 		 65 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.45 
 
 		 250 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  41.18 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  37.68 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 285 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  36.54 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  43.59 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  43.59 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  43.59 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  41.03 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.7 
 
 		 221 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  48.78 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  41.03 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  38.3 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  38.46 
 
 		 66 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>