82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4045 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  323  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  65.69 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  65.15 
 
 		 147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  64.96 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  68.94 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  63.7 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  63.7 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  65.15 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  64.12 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  62.96 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  62.96 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  63.64 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  63.64 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  63.64 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  63.64 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  63.64 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  61.82 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  61.82 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  58.93 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  59.65 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  58.18 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  62.07 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  61.82 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  56.36 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  46.27 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  44.78 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  47.62 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  47.54 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  47.54 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  42.31 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  42.31 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  42.31 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  40.38 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  42.11 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  45.45 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  36.54 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  42.55 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  36.54 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  42.55 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  36.54 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  47.73 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7333  hypothetical protein  45.45 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0363083  hitchhiker  0.00913709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  38.64 
 
 		 248 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3357  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  39.02 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3551  hypothetical protein  39.71 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  32.81 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5001  hypothetical protein  48.15 
 
 		 69 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575003  normal  0.194568 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3227  hypothetical protein  39.71 
 
 		 75 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  32.61 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  35.71 
 
 		 60 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  36.96 
 
 		 303 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2925  hypothetical protein  36.36 
 
 		 117 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4003  hypothetical protein  36.36 
 
 		 117 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  34.09 
 
 		 267 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  33.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  43.9 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.74 
 
 		 250 aa  41.2  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  36.54 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  29.41 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  40.48 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  41.46 
 
 		 72 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5406  hypothetical protein  45 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.73 
 
 		 251 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6939  hypothetical protein  45.61 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0912691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3923  hypothetical protein  39.06 
 
 		 74 aa  40.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  28 
 
 		 79 aa  40.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  36.73 
 
 		 71 aa  40.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3056  hypothetical protein  38.89 
 
 		 85 aa  40.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  40.48 
 
 		 70 aa  40.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>