37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3227 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3227  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  149  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3551  hypothetical protein  96 
 
 
88 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3357  hypothetical protein  89.04 
 
 
75 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3257  hypothetical protein  58.67 
 
 
86 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2979  hypothetical protein  58.67 
 
 
86 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0076  hypothetical protein  58.67 
 
 
86 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961421  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0005  hypothetical protein  64.62 
 
 
71 aa  87.8  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.711557  normal  0.0680728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0094  hypothetical protein  58.67 
 
 
76 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.628035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0076  hypothetical protein  58.67 
 
 
86 aa  87.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0067  hypothetical protein  58.67 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0075  hypothetical protein  58.67 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639778  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0005  hypothetical protein  57.97 
 
 
74 aa  85.9  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.221956  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2984  hypothetical protein  57.33 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3923  hypothetical protein  58.46 
 
 
74 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3056  hypothetical protein  56 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4077  hypothetical protein  57.33 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0182357  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1618  hypothetical protein  57.33 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3385  hypothetical protein  57.33 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2925  hypothetical protein  57.33 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4003  hypothetical protein  57.33 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0009  hypothetical protein  56.92 
 
 
74 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6939  hypothetical protein  52.31 
 
 
73 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0912691  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7333  hypothetical protein  47.69 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0363083  hitchhiker  0.00913709 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  45.59 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  41.43 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  41.43 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5602  hypothetical protein  50.98 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  38.24 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5001  hypothetical protein  44.78 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575003  normal  0.194568 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6513  hypothetical protein  41.67 
 
 
83 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521299  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5406  hypothetical protein  45.45 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  39.71 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  35.29 
 
 
136 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>