35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_5001 on replicon NC_010683
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010683  Rpic_5001  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575003  normal  0.194568 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5406  hypothetical protein  91.3 
 
 		 69 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91124  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7555  hypothetical protein  40.68 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0181616 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7333  hypothetical protein  44.12 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0363083  hitchhiker  0.00913709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3357  hypothetical protein  44.93 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5602  hypothetical protein  41.79 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0005  hypothetical protein  47.17 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.221956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3227  hypothetical protein  44.78 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0005  hypothetical protein  51.06 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.711557  normal  0.0680728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  37.68 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  48.15 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3551  hypothetical protein  43.28 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6939  hypothetical protein  42.37 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0912691  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3056  hypothetical protein  47.73 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3923  hypothetical protein  40.68 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0009  hypothetical protein  40.68 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  45.45 
 
 		 147 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  45.45 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5010  hypothetical protein  40.3 
 
 		 81 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6513  hypothetical protein  41.79 
 
 		 83 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  45.45 
 
 		 147 aa  40.8  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3257  hypothetical protein  43.18 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2979  hypothetical protein  43.18 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0075  hypothetical protein  43.18 
 
 		 76 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0067  hypothetical protein  43.18 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727521  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0094  hypothetical protein  43.18 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628035 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0076  hypothetical protein  43.18 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961421  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0076  hypothetical protein  43.18 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  43.18 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  43.18 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2984  hypothetical protein  43.18 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4077  hypothetical protein  43.18 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0182357  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1618  hypothetical protein  43.18 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3385  hypothetical protein  43.18 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>