38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3357 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3357  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3551  hypothetical protein  89.04 
 
 		 88 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3227  hypothetical protein  89.04 
 
 		 75 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0005  hypothetical protein  65.15 
 
 		 71 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.711557  normal  0.0680728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3257  hypothetical protein  62.32 
 
 		 86 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2979  hypothetical protein  62.32 
 
 		 86 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0076  hypothetical protein  62.32 
 
 		 86 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0094  hypothetical protein  62.32 
 
 		 76 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0076  hypothetical protein  62.32 
 
 		 86 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0067  hypothetical protein  62.32 
 
 		 86 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727521  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0005  hypothetical protein  60.94 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.221956  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0075  hypothetical protein  62.32 
 
 		 76 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3923  hypothetical protein  60.94 
 
 		 74 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3056  hypothetical protein  60.87 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0009  hypothetical protein  59.38 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2925  hypothetical protein  59.42 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3385  hypothetical protein  59.42 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2984  hypothetical protein  59.42 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4077  hypothetical protein  59.42 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0182357  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4003  hypothetical protein  59.42 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1618  hypothetical protein  59.42 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6939  hypothetical protein  55.38 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0912691  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7333  hypothetical protein  46.15 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0363083  hitchhiker  0.00913709 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  45.71 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  44.29 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  48.53 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  44.29 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  44.29 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  42.65 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  43.64 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  43.64 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5602  hypothetical protein  44.12 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5001  hypothetical protein  44.93 
 
 		 69 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575003  normal  0.194568 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5406  hypothetical protein  45.59 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91124  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6513  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  39.71 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  41.18 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7555  hypothetical protein  43.33 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0181616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>