122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0737 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  76.69 
 
 		 159 aa  222  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  63.89 
 
 		 144 aa  200  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  67.61 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  67.42 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  68.7 
 
 		 147 aa  186  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  65.15 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  65.15 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  65.28 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  65.15 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  65.15 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  45.45 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  60.71 
 
 		 67 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  60.71 
 
 		 67 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  60.71 
 
 		 67 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  60.71 
 
 		 67 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  60.71 
 
 		 67 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  61.82 
 
 		 80 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  61.82 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  58.93 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  51.32 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  58.93 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  58.93 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  58.93 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  58.93 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  58.93 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  58.93 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  58.93 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  47.14 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  55.36 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  56.14 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  53.57 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  50.79 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  44 
 
 		 70 aa  60.1  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3257  hypothetical protein  46.88 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  47.06 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  47.06 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  45.1 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  47.06 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2925  hypothetical protein  46.88 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2979  hypothetical protein  46.88 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0076  hypothetical protein  46.88 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961421  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4003  hypothetical protein  46.88 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0076  hypothetical protein  46.88 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0094  hypothetical protein  46.88 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0075  hypothetical protein  46.88 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0067  hypothetical protein  46.88 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3385  hypothetical protein  46.88 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1618  hypothetical protein  46.88 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4077  hypothetical protein  46.88 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0182357  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2984  hypothetical protein  46.88 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  48.89 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  48.89 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3357  hypothetical protein  45.71 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  46.67 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  41.67 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3056  hypothetical protein  43.75 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7333  hypothetical protein  41.43 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0363083  hitchhiker  0.00913709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  41.18 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  37.14 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3923  hypothetical protein  45.31 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0009  hypothetical protein  41.79 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  51.16 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3551  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  41.18 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3227  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5602  hypothetical protein  48.94 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6513  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  40.48 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  40.91 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  30.43 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  35.56 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  31.37 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  29.63 
 
 		 248 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6939  hypothetical protein  40.98 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0912691  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0005  hypothetical protein  47.83 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.711557  normal  0.0680728 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  32.65 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.29 
 
 		 250 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  34.09 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7555  hypothetical protein  42.22 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0181616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  51.72 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  38.64 
 
 		 267 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  38.64 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  32.61 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  30.43 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  34.62 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  43.64 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  30.56 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  43.64 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  29.63 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  43.64 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  32.73 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  34.88 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  32.61 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>