77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1581 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  72.84 
 
 		 80 aa  120  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  77.78 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  77.78 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  77.78 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  76.19 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  77.78 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  77.78 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  74.6 
 
 		 67 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  74.6 
 
 		 67 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  74.6 
 
 		 67 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  74.6 
 
 		 67 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  74.6 
 
 		 67 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  74.6 
 
 		 67 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  74.6 
 
 		 67 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  76.19 
 
 		 67 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  74.6 
 
 		 80 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  73.02 
 
 		 67 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  59.3 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  71.43 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  69.84 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  68.66 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  66.67 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  66.67 
 
 		 86 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  68.42 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  60 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  60 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  55.36 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  61.82 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  53.57 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  55.56 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  53.57 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  51.79 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  50.91 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  46.94 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  46.94 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  53.7 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  46.94 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  45.45 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  45.45 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  44.9 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  45.45 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  52.83 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  43.18 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  43.18 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  40.91 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  46.81 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  40.91 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  44.23 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  44.19 
 
 		 267 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  35.09 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  38.78 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  31.25 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  41.03 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  41.03 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  38.64 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  37.25 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  46.34 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  36.54 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  36.73 
 
 		 67 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  37.25 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  37.25 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  43.9 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  37.25 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  45.45 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  38.46 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  42.55 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 285 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  36.54 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  36.54 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  36.54 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  31.65 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  41.18 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  39.22 
 
 		 103 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  34.62 
 
 		 74 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>