116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3008 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  98.04 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  94.12 
 
 		 102 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  90.2 
 
 		 102 aa  192  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  79.21 
 
 		 101 aa  169  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  78.22 
 
 		 101 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  77.23 
 
 		 102 aa  166  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  77.23 
 
 		 101 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  77.23 
 
 		 101 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  73.79 
 
 		 103 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  70.65 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  66.02 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  63.11 
 
 		 104 aa  140  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  57 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  77.65 
 
 		 90 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  60.38 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  66.67 
 
 		 82 aa  99.4  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  52.94 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  67.74 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  64.52 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  67.27 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  67.27 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  66.1 
 
 		 81 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  51.25 
 
 		 88 aa  86.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  60 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  60 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  50.62 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  53.42 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  53.42 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  53.42 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  53.42 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  59.32 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  39.05 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  50.85 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  39.78 
 
 		 86 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  41.76 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  40.21 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  44.44 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  44.44 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  44.44 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.18 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  46.3 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  54.76 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  51.22 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  42.59 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  52.38 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  46 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  46 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  48.84 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  42.59 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  46.51 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  35.19 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  36.11 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  53.85 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  44.19 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  42.22 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  42.22 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  42.11 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  44.19 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  38.46 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1535  hypothetical protein  64.29 
 
 		 50 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0662033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1736  hypothetical protein  64.29 
 
 		 50 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.122671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1905  hypothetical protein  64.29 
 
 		 50 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1548  hypothetical protein  64.29 
 
 		 50 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  47.62 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  58.06 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  45.45 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  36.11 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  37.04 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1608  hypothetical protein  60.71 
 
 		 50 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  39.62 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  41.38 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  35.85 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  48.72 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  40.38 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  33.96 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  48.72 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  48.72 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  48.72 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  32.81 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  48.72 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  48.72 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  48.72 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  48.72 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  43.18 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  31.82 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  48.72 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>