60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2057 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2057  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  33.63 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  39.81 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  39.81 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  39.47 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  39.81 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  37.96 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  39.81 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  37.93 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  37.74 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  37.74 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  37.04 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23480  hypothetical protein  36.11 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  46.15 
 
 
303 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  50 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  51.72 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  37.88 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  37.88 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  51.72 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  44.9 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  44.9 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  44.9 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  44.9 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  44.9 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  44.9 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  41.67 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  32.88 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  42.86 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  44.19 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  43.75 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  38.1 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  43.75 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  39.53 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  42.31 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  43.75 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  42.42 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  41.07 
 
 
78 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  40.82 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1060  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2126  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984466  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0105  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  48.72 
 
 
76 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  48.72 
 
 
76 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  44 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  39.58 
 
 
95 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  50 
 
 
59 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  36.36 
 
 
58 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  43.48 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  40.38 
 
 
70 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>