14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7555 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7555  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  157  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0181616 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5001  hypothetical protein  40.68 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575003  normal  0.194568 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5406  hypothetical protein  44.83 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  34.33 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  30.77 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  38.3 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  38.3 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  39.39 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  43.59 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  42.22 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6513  hypothetical protein  36.07 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521299  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  34.69 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  40 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3357  hypothetical protein  43.33 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>