156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0438 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  100 
 
 		 79 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  84.72 
 
 		 81 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  70.49 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  63.79 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  58.73 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  66.04 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  52.24 
 
 		 74 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  62.96 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  68.63 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  68.63 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  64.15 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  58.18 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  66.67 
 
 		 52 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  54.1 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.14 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  56.6 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  55 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  53.45 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  58 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  53.7 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  49.15 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  47.62 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  58.33 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  52.63 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  52.63 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  47.17 
 
 		 58 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  51.85 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  52.73 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  38.16 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  54 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  54 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  54 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  54 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  44.26 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  46.77 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  46.15 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  47.06 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  45.61 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  46.3 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  47.17 
 
 		 303 aa  53.9  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  51.06 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  44.07 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  44.68 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  44.19 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  40.74 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  41.07 
 
 		 55 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  41.86 
 
 		 57 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  41.38 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  43.75 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  36.84 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  41.07 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  39.22 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  41.51 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  39.68 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  40.43 
 
 		 72 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  54.05 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  39.68 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  47.37 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  48.94 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  52.38 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  38 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  41.07 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  38.71 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  44 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  36.51 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  45.61 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  38.98 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  45.28 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  46.81 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  64.29 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  42.55 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  39.58 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  47.73 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  55.56 
 
 		 285 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  41.07 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  45.24 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  45.24 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  38.89 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  40.82 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  30.51 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  46.51 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  45.24 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  38.1 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  45.24 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  46.51 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  48.84 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  46.51 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>