83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1367 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  157  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  66.67 
 
 		 75 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  63.89 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  63.89 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  63.89 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  63.89 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  63.89 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  62.5 
 
 		 77 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  62.5 
 
 		 77 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  62.5 
 
 		 77 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  61.97 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  59.72 
 
 		 77 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  60.81 
 
 		 76 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  61.11 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  54.17 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  38.1 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  44.64 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  41.82 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  46.94 
 
 		 70 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  38.3 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  38.3 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  37.93 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  45.83 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  38.78 
 
 		 65 aa  50.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  42 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  39.62 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  46.94 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  35.71 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  40.35 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  44.74 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  38.89 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  44.19 
 
 		 267 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  38.89 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  35.71 
 
 		 248 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  39.22 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  42.55 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  38.78 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  38.78 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  35.29 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  40.82 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  45.45 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  38.78 
 
 		 285 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.54 
 
 		 250 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  40.82 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  40.82 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  36.73 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  43.48 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  40.82 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  39.22 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0775  hypothetical protein  37.74 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.385738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.08 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  41.03 
 
 		 74 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  41.03 
 
 		 74 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  33.85 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  36.73 
 
 		 80 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  41.03 
 
 		 74 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  39.22 
 
 		 55 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  42 
 
 		 78 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  34.09 
 
 		 147 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  41.03 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  34 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  37.21 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  38.64 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  32.65 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  38.78 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  38.46 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  34.69 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  38.78 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  34.04 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>