47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0775 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0775  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.385738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05426  hypothetical protein  56.86 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001484  hypothetical protein  55 
 
 		 80 aa  97.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  32.05 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  40.43 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  42.86 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  39.29 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  44.9 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  40.38 
 
 		 57 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  42 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3394  hypothetical protein  27.55 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  37.74 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  40.91 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  43.18 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  40.91 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  36.73 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  37.21 
 
 		 65 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  30.19 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  40.91 
 
 		 61 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  39.06 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  42 
 
 		 88 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  32.2 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  43.48 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  40.82 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  32.2 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  32.2 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  25.24 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1894  hypothetical protein  41.3 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000730808  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  41.46 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  36.96 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  40.91 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  38.1 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  40.48 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  41.46 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  35.71 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  39.02 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  32.69 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  39.02 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  37.25 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  39.02 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  39.02 
 
 		 70 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  36.17 
 
 		 73 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>