67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2664 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  100 
 
 
76 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  98.68 
 
 
76 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  98.68 
 
 
76 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  96.05 
 
 
76 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  66.15 
 
 
70 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2574  hypothetical protein  60.29 
 
 
71 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00818441  normal  0.348438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2412  hypothetical protein  63.64 
 
 
68 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0100281  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2482  hypothetical protein  60.61 
 
 
68 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133644  normal  0.19814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  60.61 
 
 
71 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  58.62 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  53.85 
 
 
70 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  52.08 
 
 
77 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2717  hypothetical protein  49.02 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2617  hypothetical protein  48.08 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2550  hypothetical protein  48.08 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.379363  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  43.86 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1367  hypothetical protein  38.3 
 
 
74 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  41.67 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1548  hypothetical protein  43.75 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1578  hypothetical protein  43.75 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2802  protein of unknown function DUF1289  43.75 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743329  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1544  hypothetical protein  43.75 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.216723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  45.76 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  36.51 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  38.6 
 
 
78 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  36.73 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  56.76 
 
 
285 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  44.07 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  52.94 
 
 
78 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  40.82 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  39.58 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  42.11 
 
 
267 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  43.4 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  38.33 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  41.18 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  38.3 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  42.55 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  44.44 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  36 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  36.92 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  33.33 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  43.4 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  43.86 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  60.61 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  42.86 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  38.33 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  37.5 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  43.64 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  41.18 
 
 
56 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  38 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  35.71 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  44.23 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  44.19 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  48.48 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  48.48 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  36.21 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  48.48 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  41.07 
 
 
248 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  38.46 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  48.48 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  37.25 
 
 
76 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  35.85 
 
 
72 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  38.6 
 
 
64 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  38.6 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  36.36 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>