67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3354 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  223  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  58.46 
 
 		 88 aa  91.3  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  52.54 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  44.87 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  44.87 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  50.85 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  42.25 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  53.57 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  50.85 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  50.85 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  50.85 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  56.86 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  50.85 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  50.85 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  47.46 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  50.85 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  45.33 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  45.76 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  49.18 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  49.15 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  49.15 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  49.15 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  49.15 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  37.18 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  50.98 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  37.33 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  39.74 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  37.33 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  37.33 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  37.33 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  39.19 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  42.65 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  36.59 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  46.55 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  43.1 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  38.98 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  32.69 
 
 		 60 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  41.38 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  42.22 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  45.1 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  41.67 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  35.71 
 
 		 58 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  39.53 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  30.67 
 
 		 110 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  41.86 
 
 		 61 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  38.64 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  38.64 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  36.84 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  40.48 
 
 		 267 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  39.53 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  39.53 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  36.84 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 285 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  38 
 
 		 248 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  34.55 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1507  hypothetical protein  36.73 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  34.62 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  39.53 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1739  hypothetical protein  32.65 
 
 		 77 aa  40  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  39.53 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  34.69 
 
 		 81 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>