89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4109 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  96.72 
 
 		 61 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  96.72 
 
 		 61 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  72.13 
 
 		 61 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  72.13 
 
 		 61 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  78.26 
 
 		 112 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  56.14 
 
 		 61 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  54.55 
 
 		 57 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  52.63 
 
 		 57 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  52.73 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  38.98 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  41.82 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  39.34 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  47.73 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  35 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  45.1 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  38.33 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  48.84 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  48.84 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  36.21 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  42.59 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  48.84 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06026  hypothetical protein  34.55 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  46.51 
 
 		 52 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  46.51 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.04 
 
 		 250 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  41.86 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  46.51 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  42.59 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  43.1 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  32.08 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  34.48 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  42.22 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  41.82 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  38.1 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.38 
 
 		 221 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  36.84 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  41.86 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  41.86 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  41.86 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  38.33 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  38.18 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  36.73 
 
 		 79 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  43.14 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  40.48 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  44.19 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  36.67 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  43.14 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  42.22 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  40.48 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  44.19 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  44.19 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  46.34 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  42.22 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  38.98 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  37.78 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  40.48 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  37.78 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  33.9 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  37.74 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  40.68 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  38.18 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  39.53 
 
 		 101 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  40.48 
 
 		 88 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  38.18 
 
 		 94 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  30.19 
 
 		 78 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  39.53 
 
 		 101 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  29.82 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  35.29 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  37.21 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  36.67 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  35.94 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  35.56 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  38.46 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  40.35 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2180  hypothetical protein  32.08 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  29.41 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  40.48 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  32.69 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  37.78 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  33.9 
 
 		 72 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  43.64 
 
 		 56 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>