78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1491 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  80.95 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  79.37 
 
 		 63 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  59.32 
 
 		 60 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  59.65 
 
 		 70 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  57.89 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5160  hypothetical protein  44 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2468  hypothetical protein  44 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.835928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2233  hypothetical protein  44 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256275  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3157  hypothetical protein  34.04 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982589  normal  0.105283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2864  hypothetical protein  34.04 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2107  hypothetical protein  34.78 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3626  hypothetical protein  34.78 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2290  hypothetical protein  34.78 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  38.18 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  53.06 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  37.5 
 
 		 303 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  37.74 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  45.28 
 
 		 248 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  38.6 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  36.36 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  41.07 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  52.17 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  52.17 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  36.36 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  52.17 
 
 		 52 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  38.18 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  45 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  41.27 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  33.93 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  40.48 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  39.53 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  44 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  32.73 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  36.36 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  34.55 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  47.83 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  39.02 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  46.67 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  39.53 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  42.22 
 
 		 78 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  42.59 
 
 		 68 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  45 
 
 		 80 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  37.74 
 
 		 79 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  38.33 
 
 		 57 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  33.8 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  41.3 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  41.03 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  42.5 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  35.42 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  35.42 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  35.19 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  48.72 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  35.71 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  44.74 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  47.37 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  47.37 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  44.44 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  47.37 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  47.37 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  47.37 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  43.59 
 
 		 267 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4664  hypothetical protein  34.43 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  47.37 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  31.67 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  40.91 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  40.91 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  47.37 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>