82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1889 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  100 
 
 		 68 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  87.5 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06026  hypothetical protein  44.64 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  46.3 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  45.9 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  50.98 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  43.64 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  43.64 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  48.08 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  45.45 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  44.64 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  53.66 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  42.19 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  41.82 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  46 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  44.07 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  44.26 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  57.45 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  57.45 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  38 
 
 		 57 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  37.25 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  57.45 
 
 		 52 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  39.34 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  44 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  47.83 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  33.33 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  37.1 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  41.18 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  35.09 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  43.14 
 
 		 55 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  48.78 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  38 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  45.65 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  45.65 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  38.6 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  39.29 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  46.81 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44 
 
 		 251 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  45.1 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  55.32 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  41.18 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  39.53 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  48.94 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  38.6 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  40.74 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  35.09 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  37.29 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  38 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  41.18 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.65 
 
 		 221 aa  43.5  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  60.71 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  44.44 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  38.3 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  33.9 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  39.13 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  37.5 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  43.48 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  44.44 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  42.55 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  39.22 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  43.14 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  40.74 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  46.15 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  51.06 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  51.06 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  38.18 
 
 		 91 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  51.06 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  36.96 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  42.59 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  42.22 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3916  hypothetical protein  39.06 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0635913  hitchhiker  0.00318943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  43.75 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2233  hypothetical protein  41.67 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256275  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  37.5 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  35.59 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2468  hypothetical protein  41.67 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.835928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3157  hypothetical protein  33.96 
 
 		 63 aa  40  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982589  normal  0.105283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  34.69 
 
 		 58 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>