37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2468 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2468  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.835928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2233  hypothetical protein  96.61 
 
 		 60 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256275  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5160  hypothetical protein  78.95 
 
 		 57 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2864  hypothetical protein  71.67 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3157  hypothetical protein  66.67 
 
 		 63 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982589  normal  0.105283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3626  hypothetical protein  76.92 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2290  hypothetical protein  76.92 
 
 		 66 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2107  hypothetical protein  75 
 
 		 66 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  36.54 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  44 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  38 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  36.54 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  36.36 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  36.36 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  44 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  36.36 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  42 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  35.09 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  39.22 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  40.91 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  40.82 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  35.09 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  32.79 
 
 		 79 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  37.5 
 
 		 248 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  37.25 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  32.14 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  36.73 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  31.03 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  36 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  41.67 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  36 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>