105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3289 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  100 
 
 
101 aa  209  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  99.01 
 
 
101 aa  208  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  98.02 
 
 
101 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  98.02 
 
 
101 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  96.04 
 
 
102 aa  201  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  80.2 
 
 
102 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  80.2 
 
 
102 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  79.21 
 
 
102 aa  169  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  77.23 
 
 
102 aa  168  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  79.12 
 
 
103 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  70.41 
 
 
121 aa  148  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  67.96 
 
 
103 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  61.17 
 
 
104 aa  140  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  63.54 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  72.22 
 
 
90 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  60.38 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  51.22 
 
 
82 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  63.49 
 
 
82 aa  96.7  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  64.52 
 
 
88 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  69.49 
 
 
81 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  49.44 
 
 
88 aa  90.5  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  58.9 
 
 
79 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  62.9 
 
 
121 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  62.9 
 
 
121 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  37.14 
 
 
106 aa  87.8  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  54.79 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  54.79 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  61.67 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  54.79 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  54.79 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  45.16 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  54.79 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  61.67 
 
 
79 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  51.47 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  50.85 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  40.22 
 
 
86 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  40.66 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  38.36 
 
 
285 aa  57  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  54.76 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  43.84 
 
 
73 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  50 
 
 
79 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  48 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  48 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  48.89 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  44.9 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  48 
 
 
52 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  43.75 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  46.51 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.22 
 
 
250 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  40 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  41.27 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  42.22 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  42.22 
 
 
57 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  33.33 
 
 
60 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  47.92 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  43.1 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  37.78 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1548  hypothetical protein  67.86 
 
 
50 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1535  hypothetical protein  67.86 
 
 
50 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0662033  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1736  hypothetical protein  67.86 
 
 
50 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.122671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1905  hypothetical protein  67.86 
 
 
50 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  42.59 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  35.85 
 
 
88 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  44.9 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1608  hypothetical protein  64.29 
 
 
50 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  37.04 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  42.22 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  35.85 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  44 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  37.29 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  38.46 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  38.46 
 
 
64 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  42 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  40.62 
 
 
87 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  39.53 
 
 
61 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  39.22 
 
 
267 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  36 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  30.38 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  43.59 
 
 
248 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.67 
 
 
221 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  41.82 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  42 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  28.33 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  40.38 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1443  hypothetical protein  38.3 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2274  hypothetical protein  48.72 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  34.38 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  34.48 
 
 
59 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  48.72 
 
 
67 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  48.72 
 
 
67 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1790  hypothetical protein  48.72 
 
 
67 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.669453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2181  hypothetical protein  48.72 
 
 
67 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0291643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>