34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1535 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1548  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1905  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1736  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.122671  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1535  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0662033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1608  hypothetical protein  98 
 
 		 50 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  80 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  76 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  76 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  76 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  76 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  76 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  65.31 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  65.31 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  60 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  58 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  58 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  49.02 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  43.75 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  67.86 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  64.29 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  64.29 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  67.86 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  67.86 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  67.86 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  67.86 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  67.86 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  64.29 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  38.81 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  64.29 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  71.43 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  60.71 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  60.71 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  57.14 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2562  hypothetical protein  57.89 
 
 		 38 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>