15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2562 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2562  hypothetical protein  100 
 
 		 38 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  86.84 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  65.79 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  65.79 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  65.79 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  65.79 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  65.79 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  60.53 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1548  hypothetical protein  57.89 
 
 		 50 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1535  hypothetical protein  57.89 
 
 		 50 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0662033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1736  hypothetical protein  57.89 
 
 		 50 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.122671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1905  hypothetical protein  57.89 
 
 		 50 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1608  hypothetical protein  57.89 
 
 		 50 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>