More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1948 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1948  histidine kinase  100 
 
 		 727 aa  1414    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0644671  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 		 815 aa  233  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 812 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 818 aa  230  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6655  histidine kinase  32.8 
 
 		 688 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404692  hitchhiker  0.00000625165 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3921  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 808 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.799409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3808  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 808 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0284545  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6654  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 		 829 aa  224  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000220106 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2834  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 808 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83958  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0191  sensor protein EvgS  31.42 
 
 		 830 aa  211  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.337786  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0144  sensor protein evgS precursor  31.1 
 
 		 830 aa  208  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  30.08 
 
 		 948 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0062  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 807 aa  187  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 932 aa  184  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30700  putative sensor/response regulator hybrid  30.12 
 
 		 992 aa  184  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.716544  hitchhiker  0.000396049 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 573 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02280  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  32.09 
 
 		 1197 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1287  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 1197 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1011 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1299  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  32.09 
 
 		 1197 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  32.43 
 
 		 810 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02241  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1197 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2507  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  32.09 
 
 		 1197 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0203632  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 1002 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2739  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  31.82 
 
 		 1197 aa  177  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.485487  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2657  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  31.82 
 
 		 1197 aa  177  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2520  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  31.64 
 
 		 1127 aa  177  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 1199 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 781 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  34.4 
 
 		 651 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3601  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  31.1 
 
 		 1127 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.317303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 1029 aa  174  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  34.64 
 
 		 741 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 969 aa  174  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5320  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 903 aa  173  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  32.58 
 
 		 1213 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 846 aa  173  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02306  hypothetical protein  31.06 
 
 		 576 aa  173  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0671  sensor histidine kinase LuxQ  34.6 
 
 		 857 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 827 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 939 aa  173  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 957 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 674 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 874 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 678 aa  171  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 947 aa  171  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  31 
 
 		 630 aa  170  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 614 aa  170  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 1127 aa  170  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  31.92 
 
 		 1209 aa  170  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 944 aa  170  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  31 
 
 		 630 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1433 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 721 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 1204 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 846 aa  168  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 631 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 859 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 1003 aa  168  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  26.15 
 
 		 782 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  34.47 
 
 		 645 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  24.31 
 
 		 497 aa  167  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 		 801 aa  167  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  31.66 
 
 		 810 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  33.85 
 
 		 641 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 		 662 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 880 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 901 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  33.25 
 
 		 651 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  31.76 
 
 		 882 aa  165  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 		 643 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 803 aa  165  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 1691 aa  164  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 847 aa  164  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 		 695 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1229  hybrid sensory histidine kinase TorS  34.74 
 
 		 904 aa  164  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 1363 aa  164  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  31.13 
 
 		 1040 aa  164  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 		 913 aa  164  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  34.4 
 
 		 914 aa  164  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  31.55 
 
 		 661 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 641 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1110  hybrid sensory histidine kinase TorS  34.99 
 
 		 914 aa  163  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00372691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2649  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 899 aa  163  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0141024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  34.99 
 
 		 904 aa  163  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 627 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1104  hybrid sensory histidine kinase TorS  34.74 
 
 		 914 aa  163  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 962 aa  163  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0844  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  29.66 
 
 		 669 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.644717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  36.01 
 
 		 2109 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 		 974 aa  163  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1753  sensor protein LuxQ  30.34 
 
 		 583 aa  163  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  29.52 
 
 		 1871 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 911 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00996  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with TorR  34.74 
 
 		 914 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458275  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 643 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01003  hypothetical protein  34.74 
 
 		 914 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.624093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 		 572 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1420  sensory box histidine kinase/response regulator  34.86 
 
 		 1199 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1187  two component system histidine kinase  29.4 
 
 		 683 aa  161  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.572633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>