More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08710  glycosyltransferase  100 
 
 		 374 aa  731    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  20.82 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1496  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.94 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11940  glycosyltransferase  34.81 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0997293  normal  0.0817193 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.64 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  33.91 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.42 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.11 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25.53 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 		 773 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  32.69 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  25.84 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 		 744 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1563  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 743 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.83 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  36.44 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.72 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  19.45 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  37.38 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.68 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  35.78 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  25 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 379 aa  57  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.54 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  28.65 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.73 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  23.04 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 		 456 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  21.43 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  30.89 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  39.08 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4454  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1433  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  30.9 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2021  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  24.46 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.45 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  38.79 
 
 		 412 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0659  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 756 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  31.43 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 400 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>