103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0371 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  100 
 
 
915 aa  1874    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  29.95 
 
 
614 aa  134  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2404  Arylsulfotransferase  27.35 
 
 
1349 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  26.07 
 
 
628 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  27.43 
 
 
626 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  28.2 
 
 
374 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  27.33 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  27.44 
 
 
374 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  27.44 
 
 
374 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5000  arylsulfotransferase  28.53 
 
 
558 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164429  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  25.41 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  25.41 
 
 
374 aa  82  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  25.41 
 
 
374 aa  82  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  25.41 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  27.54 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  26.69 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  28.03 
 
 
454 aa  81.6  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1349  hypothetical protein  25.28 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0236  arylsulfotransferase  28.53 
 
 
558 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  25.14 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  26.05 
 
 
597 aa  76.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  24.79 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08230  Arylsulfotransferase  26.6 
 
 
590 aa  76.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  25.88 
 
 
597 aa  75.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  26.26 
 
 
481 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  25.21 
 
 
450 aa  73.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  26.91 
 
 
482 aa  72.8  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1436  Arylsulfotransferase  24.52 
 
 
625 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  26.28 
 
 
597 aa  72.4  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  26.02 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1382  arylsulfotransferase  24.04 
 
 
625 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.019077  normal  0.109845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1584  arylsulfotransferase  25.8 
 
 
601 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  25.94 
 
 
600 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0436  arylsulfotransferase  26.48 
 
 
602 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  28.3 
 
 
376 aa  70.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  24.32 
 
 
473 aa  69.7  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0560  arylsulfate sulfotransferase  23.81 
 
 
616 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  27.38 
 
 
514 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4027  arylsulfotransferase  26.27 
 
 
586 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  21.83 
 
 
618 aa  68.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3450  arylsulfate sulfotransferase  25.56 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.921011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3443  arylsulfate sulfotransferase  25.56 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30935  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3378  arylsulfate sulfotransferase  25.56 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3373  arylsulfate sulfotransferase  25.56 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3545  arylsulfate sulfotransferase  25.56 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.949086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4251  hypothetical protein  27.88 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  hitchhiker  0.0000638006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3333  arylsulfate sulfotransferase  25.29 
 
 
598 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  24.29 
 
 
474 aa  67.4  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  25.62 
 
 
600 aa  67  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  27.57 
 
 
562 aa  67.4  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  25.26 
 
 
481 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  26.6 
 
 
366 aa  65.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0882  arylsulfate sulfotransferase, degenerate  27.97 
 
 
620 aa  65.9  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  24.91 
 
 
481 aa  64.7  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  24.91 
 
 
481 aa  64.7  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  27.64 
 
 
486 aa  64.3  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  27.87 
 
 
494 aa  63.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0844  arylsulfotransferase  24.92 
 
 
590 aa  62.8  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4344  arylsulfotransferase  22.55 
 
 
596 aa  62.4  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  25.24 
 
 
477 aa  62.4  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3872  arylsulfate sulfotransferase  24.55 
 
 
596 aa  61.6  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1752  arylsulfotransferase  24.76 
 
 
586 aa  61.6  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00146407  hitchhiker  0.00673142 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4314  arylsulfotransferase  22.55 
 
 
596 aa  61.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4498  arylsulfotransferase  22.55 
 
 
596 aa  61.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4429  arylsulfotransferase  22.55 
 
 
565 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4430  arylsulfotransferase  22.55 
 
 
596 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  24.39 
 
 
485 aa  59.3  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2378  hypothetical protein  23.94 
 
 
398 aa  58.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  24.66 
 
 
1022 aa  57.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0231  arylsulfotransferase  21.45 
 
 
611 aa  57  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4022  arylsulfotransferase  22.28 
 
 
596 aa  56.2  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  23.02 
 
 
483 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1149  arylsulfotransferase  23.94 
 
 
606 aa  54.7  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  35.37 
 
 
4013 aa  55.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0237  arylsulfate sulfotransferase  24.6 
 
 
567 aa  54.3  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.83 
 
 
1222 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4001  arylsulfate sulfotransferase  22.42 
 
 
591 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0413696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0236  hypothetical protein  29.32 
 
 
336 aa  52.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  30.67 
 
 
2305 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  31.85 
 
 
1222 aa  52  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0901  fructose-bisphosphate aldolase  23.45 
 
 
588 aa  51.2  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4260  arylsulfotransferase  23.9 
 
 
607 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790155  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4307  arylsulfotransferase  23.9 
 
 
607 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4188  arylsulfotransferase  23.9 
 
 
607 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4211  arylsulfotransferase  23.9 
 
 
607 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4367  arylsulfotransferase  23.9 
 
 
607 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1462  Arylsulfotransferase  25.25 
 
 
524 aa  49.3  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10116  conserved hypothetical protein  25.08 
 
 
587 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.195522  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0783  hypothetical protein  30.09 
 
 
528 aa  48.9  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.08 
 
 
1225 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12503  putative surface layer protein  33.33 
 
 
465 aa  48.1  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  30.28 
 
 
1037 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.29 
 
 
2281 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.89 
 
 
3396 aa  47  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.88 
 
 
1340 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1880  PEBP family protein  27.57 
 
 
663 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.46 
 
 
889 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1927  hypothetical protein  28.37 
 
 
422 aa  45.8  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1825  Arylsulfotransferase  25.63 
 
 
502 aa  45.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.56957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  24.07 
 
 
2310 aa  45.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>