61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1430 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  67.15 
 
 		 481 aa  680    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  68.06 
 
 		 481 aa  696    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  69.25 
 
 		 481 aa  698    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  66.74 
 
 		 485 aa  675    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  94.8 
 
 		 597 aa  1171    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  65.77 
 
 		 600 aa  834    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  82.94 
 
 		 597 aa  1038    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  81.83 
 
 		 600 aa  1043    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 597 aa  1229    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  66.53 
 
 		 481 aa  679    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  66.8 
 
 		 481 aa  682    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  62.26 
 
 		 483 aa  609  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  60.59 
 
 		 473 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  59.46 
 
 		 482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  60.13 
 
 		 477 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  59.62 
 
 		 494 aa  586  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  60.21 
 
 		 474 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  39.96 
 
 		 454 aa  293  6e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  38.88 
 
 		 450 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  40.23 
 
 		 399 aa  286  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  28.34 
 
 		 374 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  28.09 
 
 		 371 aa  114  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  27.94 
 
 		 374 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  27.94 
 
 		 374 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  27.94 
 
 		 374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  27.94 
 
 		 374 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  26.14 
 
 		 374 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  26.14 
 
 		 374 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  26.14 
 
 		 374 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  25.9 
 
 		 366 aa  107  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  26.14 
 
 		 374 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  30.66 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  26.14 
 
 		 376 aa  98.6  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  26.57 
 
 		 439 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1022 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  25.88 
 
 		 915 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  26.29 
 
 		 545 aa  64.3  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  26.03 
 
 		 434 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  26.18 
 
 		 514 aa  62  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  25.94 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04257  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 		 632 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.491798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  35.48 
 
 		 421 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  24.74 
 
 		 562 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 		 572 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  24.46 
 
 		 618 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  34.94 
 
 		 259 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  30.77 
 
 		 286 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05465  conserved hypothetical protein  27.1 
 
 		 690 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  33.7 
 
 		 155 aa  45.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  22.8 
 
 		 626 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  35.16 
 
 		 109 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  32.94 
 
 		 110 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  32.58 
 
 		 117 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  28.7 
 
 		 287 aa  44.3  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  31.33 
 
 		 257 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  32.94 
 
 		 110 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  31.88 
 
 		 338 aa  43.9  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1202  thioredoxin, putative  25.74 
 
 		 102 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.267442  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  26.55 
 
 		 289 aa  43.9  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  30.69 
 
 		 142 aa  43.9  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  29.5 
 
 		 144 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>