37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2062 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  100 
 
 
545 aa  1102    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  42 
 
 
450 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  36.78 
 
 
486 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  34.35 
 
 
434 aa  158  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  28.93 
 
 
447 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  25.4 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  26.29 
 
 
597 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  25 
 
 
481 aa  63.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  25.82 
 
 
597 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  27.49 
 
 
374 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  24.7 
 
 
597 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  28.22 
 
 
374 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  28.22 
 
 
374 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  24.73 
 
 
482 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  24.03 
 
 
474 aa  57  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  23.43 
 
 
600 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  27.34 
 
 
374 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  22.88 
 
 
481 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  22.98 
 
 
485 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  25 
 
 
374 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  25.31 
 
 
477 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  25 
 
 
374 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  25 
 
 
374 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  25 
 
 
374 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  25 
 
 
374 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  24.46 
 
 
494 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  31.95 
 
 
1022 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  22.08 
 
 
483 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  29.83 
 
 
376 aa  50.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  22.81 
 
 
473 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  27.72 
 
 
371 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05465  conserved hypothetical protein  30.08 
 
 
690 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548689  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  27.84 
 
 
377 aa  45.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  23.51 
 
 
600 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  24.87 
 
 
514 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  21.4 
 
 
481 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  21.4 
 
 
481 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>