53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2093 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  64.3 
 
 
481 aa  651    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  68.32 
 
 
482 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  998    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  67.86 
 
 
481 aa  703    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  70.59 
 
 
481 aa  729    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  68.7 
 
 
485 aa  707    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  63.1 
 
 
600 aa  647    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  62.68 
 
 
597 aa  641    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  64.63 
 
 
600 aa  663    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  63.52 
 
 
597 aa  641    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  64.72 
 
 
481 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  63.67 
 
 
481 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  62.26 
 
 
597 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  61.92 
 
 
473 aa  621  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  57.83 
 
 
494 aa  565  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  57.08 
 
 
477 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  56.16 
 
 
474 aa  544  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  40 
 
 
450 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  40.87 
 
 
399 aa  283  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  38.09 
 
 
454 aa  280  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  27.71 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  27.47 
 
 
374 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  27.47 
 
 
374 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  27.83 
 
 
371 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  26.05 
 
 
374 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  26.28 
 
 
374 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  25.81 
 
 
374 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  25.81 
 
 
374 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  26.27 
 
 
374 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  29.96 
 
 
377 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  25.64 
 
 
374 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  29.19 
 
 
366 aa  103  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  26.88 
 
 
376 aa  99.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  25.52 
 
 
439 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  23.95 
 
 
1022 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  23.83 
 
 
915 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  25.99 
 
 
434 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  24.17 
 
 
514 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  23.67 
 
 
486 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  22.14 
 
 
545 aa  53.5  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0036  arylsulfotransferase  25.6 
 
 
572 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.453558  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0035  arylsulfotransferase  25.12 
 
 
572 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0785305 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04257  conserved hypothetical protein  23.51 
 
 
632 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.491798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0037  arylsulfotransferase  25.12 
 
 
572 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  25.62 
 
 
618 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0036  arylsulfotransferase  24.64 
 
 
572 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.719743  normal  0.23108 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  25.88 
 
 
572 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  24.29 
 
 
614 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  21.43 
 
 
628 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05465  conserved hypothetical protein  25.62 
 
 
690 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548689  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  22.38 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10116  conserved hypothetical protein  22.58 
 
 
587 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.195522  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1509  arylsulfotransferase  21.46 
 
 
584 aa  43.9  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.407507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>