60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3228 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  67.36 
 
 		 597 aa  702    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  66.25 
 
 		 481 aa  683    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  68.01 
 
 		 473 aa  681    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  63.75 
 
 		 482 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  67.86 
 
 		 483 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  67.99 
 
 		 600 aa  707    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  996    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  79 
 
 		 481 aa  815    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  80.46 
 
 		 485 aa  826    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  68.06 
 
 		 597 aa  696    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  67.78 
 
 		 597 aa  700    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  66.95 
 
 		 600 aa  707    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  65.9 
 
 		 481 aa  679    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  66.39 
 
 		 481 aa  688    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  60.13 
 
 		 477 aa  618  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  62.68 
 
 		 494 aa  620  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  60.13 
 
 		 474 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  39.87 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  40.98 
 
 		 454 aa  293  6e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  40.5 
 
 		 399 aa  283  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  28.34 
 
 		 374 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  28.34 
 
 		 374 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  28.34 
 
 		 374 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  27.52 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  28.25 
 
 		 377 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  26.86 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  27.13 
 
 		 374 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  27.52 
 
 		 371 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  27.13 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  27.19 
 
 		 374 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  28.28 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  26.74 
 
 		 374 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  26.34 
 
 		 366 aa  111  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  25.96 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1022 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  26.26 
 
 		 915 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  25 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  25.1 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  25.4 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1752  arylsulfotransferase  25.84 
 
 		 586 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00146407  hitchhiker  0.00673142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4027  arylsulfotransferase  25.91 
 
 		 586 aa  53.9  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0035  arylsulfotransferase  24.76 
 
 		 572 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0785305 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0037  arylsulfotransferase  24.76 
 
 		 572 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0036  arylsulfotransferase  26.83 
 
 		 572 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.453558  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3443  arylsulfate sulfotransferase  26.28 
 
 		 598 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  22.84 
 
 		 618 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0036  arylsulfotransferase  26.8 
 
 		 572 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.719743  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3450  arylsulfate sulfotransferase  26.28 
 
 		 598 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.921011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3545  arylsulfate sulfotransferase  26.28 
 
 		 598 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.949086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3373  arylsulfate sulfotransferase  26.28 
 
 		 598 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3378  arylsulfate sulfotransferase  26.28 
 
 		 598 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  24.33 
 
 		 628 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  26.7 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0901  fructose-bisphosphate aldolase  25.99 
 
 		 588 aa  48.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  24.2 
 
 		 572 aa  46.6  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0844  arylsulfotransferase  24.91 
 
 		 590 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  23.08 
 
 		 614 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3333  arylsulfate sulfotransferase  25.27 
 
 		 598 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00350  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  28 
 
 		 300 aa  43.1  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  22.83 
 
 		 514 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>