51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6693 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  96.25 
 
 
374 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  98.66 
 
 
374 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  98.66 
 
 
374 aa  756    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  764    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  83.15 
 
 
371 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  81.74 
 
 
376 aa  617  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  56.33 
 
 
374 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  56.6 
 
 
374 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  56.6 
 
 
374 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  56.6 
 
 
374 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  56.33 
 
 
374 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  47.98 
 
 
377 aa  331  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  42.39 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  29.34 
 
 
481 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  28.34 
 
 
481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  27.21 
 
 
482 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  29.48 
 
 
485 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  29.79 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  28.34 
 
 
473 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  29.4 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  27.54 
 
 
481 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  27.3 
 
 
481 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  27.3 
 
 
481 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  29.55 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  28.4 
 
 
600 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  26.52 
 
 
474 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  26.14 
 
 
597 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  27.38 
 
 
597 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  24.82 
 
 
600 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  27.71 
 
 
483 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  27.14 
 
 
597 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  31.35 
 
 
494 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  27.6 
 
 
1022 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  25.11 
 
 
477 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  28.42 
 
 
439 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  33.65 
 
 
434 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  26.69 
 
 
915 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  26.57 
 
 
618 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  28.08 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  25.69 
 
 
447 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  24.49 
 
 
562 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  27.08 
 
 
514 aa  63.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  27.49 
 
 
545 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  29.58 
 
 
450 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2404  Arylsulfotransferase  24.07 
 
 
1349 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  24.73 
 
 
626 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  25.32 
 
 
572 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  23.74 
 
 
628 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  25.71 
 
 
351 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  28.05 
 
 
310 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1927  hypothetical protein  22.75 
 
 
422 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>