29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3530 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  911    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  42.23 
 
 
545 aa  322  8e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  31.73 
 
 
486 aa  196  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  31.86 
 
 
434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  30.73 
 
 
447 aa  127  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  29.58 
 
 
374 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  29.58 
 
 
374 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  29.58 
 
 
374 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  29.58 
 
 
374 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  28.64 
 
 
366 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  31.44 
 
 
374 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  31.44 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  31.44 
 
 
374 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  31.44 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  31.44 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  24.86 
 
 
676 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  25.91 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  26.7 
 
 
481 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  27.18 
 
 
485 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  26.03 
 
 
371 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0233  hypothetical protein  31.78 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  27.14 
 
 
482 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  28.28 
 
 
377 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  26.83 
 
 
481 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  31.58 
 
 
439 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  25.12 
 
 
481 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  26.83 
 
 
481 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  26.34 
 
 
481 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  26.34 
 
 
474 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>