50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6217 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  96.51 
 
 		 374 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  764    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  764    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  98.66 
 
 		 374 aa  756    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  82.93 
 
 		 371 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  81.47 
 
 		 376 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  56.87 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  57.14 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  57.14 
 
 		 374 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  57.14 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  56.87 
 
 		 374 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  47.98 
 
 		 377 aa  330  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  41.85 
 
 		 366 aa  305  6e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  28.92 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  28.34 
 
 		 481 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  30.05 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  27.7 
 
 		 482 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  28.85 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  29.65 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  28.12 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  25.81 
 
 		 481 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  29.8 
 
 		 450 aa  112  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  26.17 
 
 		 481 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  28.12 
 
 		 600 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  26.8 
 
 		 481 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  26.14 
 
 		 597 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  26.61 
 
 		 474 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  26.89 
 
 		 597 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  23.84 
 
 		 600 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  27.14 
 
 		 597 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  27.43 
 
 		 483 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  31.75 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1022 aa  97.1  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  29.12 
 
 		 439 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  24.89 
 
 		 477 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  28.73 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  27.44 
 
 		 915 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  25.84 
 
 		 618 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  27.56 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  25.38 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  23.62 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  29.58 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  26.47 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  28.22 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2404  Arylsulfotransferase  24.44 
 
 		 1349 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  24.73 
 
 		 626 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  23.74 
 
 		 628 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  25.74 
 
 		 572 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  26.12 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  28.51 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>