50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0361 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  67.08 
 
 
481 aa  678    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  67.43 
 
 
481 aa  676    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  67.16 
 
 
473 aa  672    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  65 
 
 
482 aa  673    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  68.7 
 
 
483 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  66.95 
 
 
600 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  65.9 
 
 
597 aa  682    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  66.74 
 
 
597 aa  675    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  80.46 
 
 
481 aa  826    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  1000    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  66.95 
 
 
481 aa  675    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  65.9 
 
 
597 aa  674    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  75.88 
 
 
481 aa  791    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  66.95 
 
 
600 aa  708    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  64.78 
 
 
494 aa  631  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  60.54 
 
 
477 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  61.18 
 
 
474 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  42.13 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  40.49 
 
 
454 aa  286  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  39.91 
 
 
399 aa  279  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  29.48 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  28.85 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  28.85 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  29.98 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  27.34 
 
 
374 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  27.34 
 
 
374 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  27.34 
 
 
374 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  27.34 
 
 
374 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  27.54 
 
 
371 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  26.92 
 
 
374 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  27.15 
 
 
366 aa  104  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  28.98 
 
 
439 aa  103  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  30.55 
 
 
377 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  27.38 
 
 
376 aa  97.8  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  32.31 
 
 
1022 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  25.98 
 
 
434 aa  60.1  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  24.38 
 
 
915 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0037  arylsulfotransferase  25.34 
 
 
572 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0035  arylsulfotransferase  25.34 
 
 
572 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0785305 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  23.23 
 
 
545 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0036  arylsulfotransferase  24.89 
 
 
572 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.453558  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  25.36 
 
 
618 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  26.38 
 
 
486 aa  54.7  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0036  arylsulfotransferase  24.89 
 
 
572 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.719743  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  27.18 
 
 
450 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 
572 aa  47.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  22.03 
 
 
628 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1752  arylsulfotransferase  24.73 
 
 
586 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00146407  hitchhiker  0.00673142 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  64.52 
 
 
310 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4027  arylsulfotransferase  26.75 
 
 
586 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>