41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1823 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  993    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  74.15 
 
 
474 aa  748    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  71.46 
 
 
494 aa  712    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  61.59 
 
 
481 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  60.13 
 
 
481 aa  618  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  60.8 
 
 
473 aa  619  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  60.54 
 
 
485 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  61.12 
 
 
597 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  60.96 
 
 
481 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  59.08 
 
 
600 aa  599  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  60.13 
 
 
481 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  60.13 
 
 
597 aa  593  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  60.13 
 
 
597 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  60.29 
 
 
600 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  59.62 
 
 
481 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  56.31 
 
 
482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  57.08 
 
 
483 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  39.24 
 
 
450 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  37.1 
 
 
454 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  36.3 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  26.44 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  30 
 
 
439 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  25.31 
 
 
374 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  25.91 
 
 
374 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  25.31 
 
 
374 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  25.31 
 
 
374 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  25.33 
 
 
374 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  25.11 
 
 
374 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  24.89 
 
 
374 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  24.89 
 
 
374 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  30.29 
 
 
377 aa  93.2  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  25.49 
 
 
374 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  25.33 
 
 
371 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  24.38 
 
 
376 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  25.37 
 
 
1022 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  25.24 
 
 
915 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  25.45 
 
 
434 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  23.85 
 
 
486 aa  57  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  25.31 
 
 
545 aa  54.7  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  48.21 
 
 
310 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  23.62 
 
 
447 aa  43.9  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>