67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1830 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  64.92 
 
 
600 aa  833    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  67.15 
 
 
481 aa  687    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  67.78 
 
 
481 aa  700    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  69.04 
 
 
481 aa  704    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  65.9 
 
 
485 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  83.14 
 
 
600 aa  1055    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  83.45 
 
 
597 aa  1046    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  67.15 
 
 
481 aa  687    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
597 aa  1230    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  94.8 
 
 
597 aa  1171    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  67.01 
 
 
481 aa  692    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  63.52 
 
 
483 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  59.88 
 
 
482 aa  608  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  60.17 
 
 
473 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  60.13 
 
 
477 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  59.21 
 
 
494 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  60 
 
 
474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  39.53 
 
 
454 aa  297  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  38.88 
 
 
450 aa  294  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  39.77 
 
 
399 aa  284  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  29.37 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  28.95 
 
 
374 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  28.95 
 
 
374 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  28.95 
 
 
374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  28.95 
 
 
374 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  27.87 
 
 
371 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  26.13 
 
 
366 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  27.63 
 
 
374 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  27.14 
 
 
374 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  27.14 
 
 
374 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  30.66 
 
 
377 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  27.14 
 
 
374 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  26.89 
 
 
376 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  27.21 
 
 
439 aa  89.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  26.52 
 
 
1022 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  26.28 
 
 
915 aa  72  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  26.03 
 
 
434 aa  63.5  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  24.7 
 
 
545 aa  60.8  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  25.45 
 
 
514 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  26.32 
 
 
486 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  37.5 
 
 
155 aa  53.9  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04257  conserved hypothetical protein  23.68 
 
 
632 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.491798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  36.17 
 
 
421 aa  52  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  23.92 
 
 
618 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  34.74 
 
 
117 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  22.27 
 
 
628 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  31.07 
 
 
142 aa  47.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  34.94 
 
 
259 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  32.61 
 
 
144 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02186  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 
572 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0354311  normal  0.214267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  32.61 
 
 
144 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  32.04 
 
 
108 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  22.53 
 
 
626 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  32.04 
 
 
108 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  31.52 
 
 
144 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  35.29 
 
 
150 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  34.78 
 
 
144 aa  45.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  31.07 
 
 
108 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  33.33 
 
 
144 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  32.32 
 
 
111 aa  44.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05465  conserved hypothetical protein  26.45 
 
 
690 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548689  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  32.97 
 
 
108 aa  44.3  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  31.18 
 
 
110 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2669  thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
108 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.237733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  32.26 
 
 
109 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  31.18 
 
 
110 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  31.03 
 
 
257 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>