44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08210 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  912    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  62.56 
 
 
454 aa  550  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  62.63 
 
 
399 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  40.64 
 
 
482 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  39.62 
 
 
600 aa  317  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  40.04 
 
 
481 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  40.77 
 
 
481 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  40.6 
 
 
600 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  40.77 
 
 
481 aa  309  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  40.6 
 
 
481 aa  309  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  42.13 
 
 
485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  39.87 
 
 
481 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  40.08 
 
 
597 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  41.02 
 
 
473 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  39.52 
 
 
494 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  38.88 
 
 
597 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  38.88 
 
 
597 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  39.37 
 
 
474 aa  289  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  40 
 
 
483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  39.24 
 
 
477 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  32.05 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  29.47 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  29.29 
 
 
374 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  29.11 
 
 
374 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  29.11 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  29.04 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  29.55 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  29.8 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  29.8 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  30.94 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  28.75 
 
 
374 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  29.56 
 
 
439 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  32.49 
 
 
366 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  29.65 
 
 
376 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  26.97 
 
 
1022 aa  102  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  26.42 
 
 
434 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  25.21 
 
 
915 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  26.69 
 
 
614 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  26.07 
 
 
486 aa  57  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  24.46 
 
 
514 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3457  hypothetical protein  24.64 
 
 
618 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  47.37 
 
 
310 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4001  arylsulfate sulfotransferase  23.48 
 
 
591 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0413696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  23.29 
 
 
628 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>